Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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