Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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FOXQ1Q9C009 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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FOXQ1Q9C009 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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FOXQ1Q9C009 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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