Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms