Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 LINC01260-201ENST00000415889 1416 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 CDKN2AIPNLP3-201ENST00000418361 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC091132.2-201ENST00000433601 769 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL354761.1-201ENST00000434190 526 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 OR5S1P-201ENST00000453063 951 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 KLF7P1-201ENST00000490941 1048 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RN7SL472P-201ENST00000492799 293 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 MED30-204ENST00000522839 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 FLVCR2-202ENST00000539311 1221 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL157955.2-202ENST00000553921 467 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL117372.1-201ENST00000613711 459 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 Metazoa_SRP.120-201ENST00000614195 252 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 OR7A2P-202ENST00000641312 1219 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SVOPQ8N4V2 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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