Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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