Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.2 ms