Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CUL4AQ13619 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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CUL4AQ13619 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CUL4AQ13619 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CUL4AQ13619 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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