Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRHP20396 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 HMGCLL1-201ENST00000274901 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC091173.1-201ENST00000505627 2750 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC012651.1-204ENST00000495723 3881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 ALG13-225ENST00000621367 3893 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 ZNF23-202ENST00000358700 2692 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TRHP20396 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms