Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms