Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms