Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SYCP1Q15431 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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