Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms