Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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