Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CENPFP49454 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CENPFP49454 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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