Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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HOXD10P28358 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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HOXD10P28358 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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HOXD10P28358 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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HOXD10P28358 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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HOXD10P28358 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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