Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPRBP23467 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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