Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S4R3C0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S4R3C0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S4R3C0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S4R3C0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms