Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HECTD4Q9Y4D8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms