Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9Y3F1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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