Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LEMD3Q9Y2U8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LEMD3Q9Y2U8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms