Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms