Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM2AQ9Y2K7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM2AQ9Y2K7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms