Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCQ9Y266 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCQ9Y266 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms