Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms