Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms