Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms