Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSKSQ9UJT2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSKSQ9UJT2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms