Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00527Q9UJ94 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms