Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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