Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms