Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTNAP2Q9UHC6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms