Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP68Q9UHB9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms