Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACFD1Q9UGQ2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms