Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms