Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUCLA2Q9P2R7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCLA2Q9P2R7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms