Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms