Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms