Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA3Q9NZ52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms