Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms