Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP4Q9NRJ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms