Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms