Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms