Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms