Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf49Q9H6J7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms