Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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