Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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