Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF541Q9H0D2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms