Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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