Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM4Q9C037 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms