Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms